Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd1Q61345 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms