Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms