Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a1Q60714 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms