Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynrgQ5SV85 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms