Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmprss11eQ5S248 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss11eQ5S248 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms