Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm4Q4VBF2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm4Q4VBF2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm4Q4VBF2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
R3hdm4Q4VBF2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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