Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms