Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ulk4Q3V129 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms