Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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