Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim9Q3V0X1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim9Q3V0X1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms