Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc9Q3V038 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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