Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll12Q3UDE2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms