Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtpbp6Q3U6U5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Gtpbp6Q3U6U5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gtpbp6Q3U6U5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms