Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf149Q3U2C5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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