Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms