Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms