Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms