Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Trim71Q1PSW8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms