Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms