Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah1bQ06985 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah1bQ06985 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms