Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms