Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

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Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Nf1Q04690 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Nf1Q04690 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nf1Q04690 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms