Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms