Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fgfr4Q03142 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms