Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms