Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin2bQ01097 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms