Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms