Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gbp10Q000W5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gbp10Q000W5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms