Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms