Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprvP70289 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms