Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms