Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms