Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Setd4P58467 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Setd4P58467 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Setd4P58467 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Setd4P58467 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Setd4P58467 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Setd4P58467 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Setd4P58467 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Setd4P58467 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd4P58467 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd4P58467 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd4P58467 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd4P58467 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd4P58467 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd4P58467 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms