Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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