Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms