Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FmodP50608 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
FmodP50608 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms