Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd1P48410 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms