Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NodalP43021 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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NodalP43021 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NodalP43021 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms