Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VhlP40338 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VhlP40338 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VhlP40338 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms