Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CftrP26361 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CftrP26361 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CftrP26361 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CftrP26361 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CftrP26361 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CftrP26361 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms