Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChgaP26339 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChgaP26339 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms