Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkchP23298 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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