Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eif3aP23116 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms