Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxb9P20615 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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