Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NefhP19246 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NefhP19246 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NefhP19246 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NefhP19246 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NefhP19246 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms