Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms