Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaraP11416 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaraP11416 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaraP11416 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaraP11416 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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