Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P10404 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P10404 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P10404 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms