Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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