Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Ab1P01921 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Ab1P01921 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms